Việc áp dụng hệ thống quản lý chất lượng (HTQLCL) theo tiêu chuẩn ISO 9001: 2008 vào hoạt động của cơ quan hành chính nhà là một nhiệm vụ quan trọng trong quá trình cải cách thủ tục hành chính. Chi cục ATVSTP Quảng Trị đã thể hiện quyết tâm áp dụng ISO vào hoạt động quản lý và đã được Tổng cục Tiêu chuẩn Đo lường Chất lương Cấp giấy chứng nhận.

Nhằm thể hiện sự công khai, minh bạch, đem lại hiệu quả, thuận lợi cho tổ chức, đơn vị, cá nhân trong hoạt động an toàn vệ sinh thực phẩm và trên hết là xây dựng đội ngũ cán bộ công chức ngày càng chuyên nghiệp trong giải quyết công việc hành chính công, Chi cục đã tiến hành xây dựng, áp dụng và triển khai hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn TCVN 9001:2008 từ tháng 6/2013.