Quản lý và sử dụng kinh phí chương trình mục tiêu An toàn thực phẩm năm 2016, được thực hiện theo công văn số 9795/BTC-HCSN, ngày 15/7/2016 của Bộ tài chính, theo đó Dự án An toàn thực phẩm thuộc Chương trình mục tiêu Y tế- Dân số giai đoạn 2016-2020 được tiếp tục thực hiện theo quy định của Thông tư số 67/2013/TTLT-BTC-BYT ngày 21/05/2013.